그러나 모포누두부의 염증이 많든 적든간에 주위 결합직의 염증을 불러와 주위조직의 염증증세가 여드름 흉터을 남기게 되는데 크게 관여한다. 이 주위결합직의 염증은 모포를 따라 수평방향뿐만아니라 심부에 다다른다. 화농성염증이 심부에 미치는 경우는 심한 모포파괴를 낳고 농양을 형성한다. 이 호중구를 중심으로 한 급성화농성 염증은 나중에 임파구, 조직구의 혼입으로 육아종성으로 변하고 결국에는 염증세포의 주체가 형질세포가 되고 선유아세포, 진원선유로 된 반흔조직으로 치환된다. 

(그림) 모포주위 및 심부로의 염증이 심할수록 모포파괴가 심하며, 진피내에 모포내용물의 유출이 많고, 염증반응의 만연화와 큰 반흔조직을 만들게 된다. 가장 심한 것은 농양이 피하에까지 표피를 뚫고(천파), 이 벽을 재생한 모포상피가 피복되어 만성누공을 형성한다. (자료: http://www.medcity.com )

(그림) 여드름에 의한 반흔형성의 조직상 모포주위조직의 염증에 의해 생긴 반흔조직이 수축하면 함요성의 반흔(그림위의 화살표), 증식하면 비후성반흔이나 켈로이드가 된다. (그림 아래의 화살표) 

양자의 중간형으로서는 명확한 증식경향을 나타내지 않는 자홍색의 반상반흔이 있다. 이 경우에도 통상의 반흔과 다르며 진피내에 모포파괴산물이나 재생한 모포지선계 상피성분이 존재하기 때문에 염증은 만연하여 발적이 쇠퇴하는데는 몇 개월이나 걸린다. 

여드름 자국의 또 다른 하나는 색소침착이다. 이것은 모회염이 표재성으로 존재한 부위에서 표피에 영향을 미치고, 다른 염증성 피부질환과 마찬가지로 멜라닌에 의해 염증후 색소침착을 낳는 것이다. 여드름 치료약인 미노사이클린에 의해서도 똑같은 색소침착은 일어날 수 있다. 

이것은 염증조직이 미노사이클린과 친화성을 가지기 때문이며, 이약이 장해조직내에 생긴 헤모지데린과 결합하기 때문이라 생각된다. 미노사이클린은 침착부위가 진피내에 있기 때문에 백인중에는 재청색의 색소침착이 생기며 갈색인 염증후의 색소침착과 구별된다. 

그러나 황인종중에는 양자의 감별이 어렵다. 이상 기술한 바와 같이 모포주위조직에 확대한 화농성염증의 결과로 생긴 조직학적인 반흔조직의 출현이, 울퉁불퉁한 여드름 자국를 육안으로 볼 수 있는 원인이다. 또 염증이 표피로 퍼져 색소침착을 낳는 원인이 된다.